В 1 сезоне сериала «Алькатрас» доктора Диего Сото приглашают в Сан-Франциско для главного научного и детективного расследования в его жизни. Дело в том, что этот ученый посвятил свою жизнь и карьеру изучению самой известной и неприступной американской тюрьмы Алькатрас. Теперь он – единственный человек в мире, способный раскрыть одну из главных загадок XX века. В военные годы из тюрьмы странным образом исчезают несколько заключенных вместе с их охранниками. Но после закрытия Алькатраса в 1963 году пропавшие неожиданно объявляются вновь. Диего должен выяснить, куда и каким образом они исчезали.